La sede de Fátima dispone del servicio médico con asistencia en el propio centro. El objetivo de este Servicio frente a accidentes escolares, es poder atender con rapidez y profesionalidad a los alumno/as, evitando traslados a las familias.
No obstante, se dan casos en los que la derivación a la clínica es necesaria.
En la sede de Tiboli todos los alumnos están cubiertos por el Seguro Escolar Obligatorio, con asistencia en el Hospital de Basurto.
Ambas sedes cuentan con un Desfibrilador (DEA) con personal cualificado y formado en curso especializado para su correcto uso.